如果在收房后的90天内未拿到房产证，可能是由于以下几种原因造成的：
1、开发商本身资质不够，无法办理房产下，这种情况需要业主进行维权，要求开发商尽快办理房产证并且承担相应的赔偿责任。
2、房产证已经办理，由于是按揭贷款买方，房产证办理后银行作为抵押留存，直到购房者还清房贷后才将房产证归还。这种情况下购房者只能等贷款还清后拿到房产证。当然购房者也可以提前还款，进而提前拿到房产证，一般需要15-20个工作日拿到房产证。
3、房产证已经办理，由于是按揭贷款买方，房产证办理后银行作为抵押留存，也有银行必须由购房者本人申请取回房产证，当然申请过程中需要办理抵押产权登记。
另外现在有部分银行不会留存房产证的原件作为抵押，只是房产证内页的《设定他项权利》一栏中会盖抵押登记章，然后将房产原件发给购房者。房产证在购房者手里，而他项权利证在银行，等到贷款还清后，就可以去银行将他项权证拿回来，然后去交易注销抵押。
办理住房贷款，抵押在银行的不是房产证而是他项权证，属于土地证的一部分，产权完整的房子拥有房产证和土地证两证，他项权证是土地证的一部分，贷款的话要给银行保管，一次性付清的话就拥有完整两证了。
一般来说如果买的是现房，房产证会马上办理，如果买的是期房，则需要在交房的时候办理房产证。办理按揭贷款需要将他项权证抵押在银行，房产证会交给购房者保管，不过由于不同银行政策不一样，有些银行则是在购房者还清所有贷款后才交付房产证。
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